在实验开始以前，必须确认
实验室通风柜应该处于运行状态，才能进行实验操作。
实验结束前至少还要继续运行5分钟以上才可关闭通风机，以排出管道内的残留气体。也可考虑安装排风时间延时器，确保通风机延迟运行。
实验时，在距玻璃视窗150mm内不要放任何设备，全木实验台要有充足的空间，不应影响空气的流动，前面视窗尽量要关闭使用。
实验室通风柜的选择
在实验室建设时，选择实验室通风柜以及确定实验室通风柜的安装位置，需要根据实验内容来选择实验室通风柜的类型，材质、形状等，通常要考虑下列内容：
使用的实验室药品：当使用有机物或其他特殊试剂实验时，要充分考虑其控制风速。热源：当使用带热源的设备时，其热量超过2000大卡/小时时要考虑排出热量所需的通风量从而确定通风机的功率。
有放射性物质或过氯酸等实验时：要选用专用的实验室通风柜，其进风风速必须设定大于0.5m/s。
使用大型设备进行实验时：要考虑内部的有效尺寸，为排风留出必要的空间。
材质：在使用特殊酸类实验时，要考虑实验室通风柜的材质，例如半导体行业，腐蚀行业等必须要用防腐蚀的材料制造。
外形尺寸：根据实验内容选择其外形尺寸，体积太大造成浪废，过小影响使用。
环境保护：排出的有害气体如果必须确保在低于国家环保要求如果超过国家卫生标准应安装相应的净化装置。
节省能源：尽量考虑节省能源，在有采暖或空调房间内应采用补风形
实验室通风柜或选择带风量控制的通风柜。在选择通风机时，也要根据需要确定其功率，不宜盲目增大排风量和压力，可采用变频器或变风速风机的降低电耗。
在通风柜安装位置上应该避免面向道路及人员通过频繁的场地，避免堵塞窗户及通风采光不利的地方，避免遮挡出入口影响门的开关的地方，避免对置和放置在拐角墙壁处。
在现代化的研究实验室里，先进的科学仪器，完善的实验设备，良好的实验环境是提升科技水平，促进科研成果的必要条件。以人为本，确保安全，提高效率是实验室建设的最大使命。通风柜作为生化实验室里重要的实验设施有举足轻重的作用，因此必须认真的选择满足各项技术指标的实验室通风柜。怱视实验室通风柜的功能性与安全性，单纯片面压低造价而安装的实验室通风柜如果造成的危害，其后果不堪设想，应该引起人们足够的重视。
